高千穂町古墳は、三田井地区を中心に前方後円墳３基、円墳10基、横穴墓41基の計54基が指定されていたが、横穴墓を中心に所在不明となった35基が解除となっている。高千穂町古墳の横穴墓は、複室構造の玄室を有する特徴がある。なお、高千穂町内には未指定の横穴墓群も多く存在している。